洪荒大陆除了人族领地所在外，其它的地方都是很不平静，大神通者以上的战斗却是数不胜数。由于巫妖两族的清理行动，诸多紫霄宫听道的大神却是纷纷结成联盟，
并展开对巫妖双方的报复。
虽然联盟众神中有五十位准圣，但深知不是巫妖高层的对手，所以联盟众神针对巫妖领地的各城市进行打击，一时之间数不清的巫妖城市被联盟众神逐一摧毁，数十万亿的巫妖领地的精英修士被歼灭，余下的只是普通修为的生灵。
巫族十二祖巫及妖族二帝闻后大怒，派出族内高手追杀联盟众神。联盟众神数量并不多只有数千人，大部分都是顶级大罗金仙修士，只有不到五十位的准圣修士，实力最强的一位达到了准圣中期大圆满的修为。
五十位准圣分为十队带领众多大罗金仙修士，分散隐藏于洪荒各处。巫妖两族的修士都很难找到他们，只能逐一的搜查整个中央大陆，但洪荒何其大，单单是中央大陆就有数百亿亿里之大，联盟众神隐藏于洪荒各地对搜查的军队进行偷袭，高端实力比不上巫妖两族，联盟众神针对巫妖中低端修士进行打击，数千万年来联盟修士与巫妖两族之间发生了无数次的战斗。
巫族十二祖巫及妖族两帝一皇一妖师，双方都对联盟的行踪进行了无数次的推算，但是有关联盟众神的行踪的天机好像被蒙住了，两族都推算不出联盟众神的行踪，两族高层从而得知联盟背后肯定有顶级亚圣修为的至高神通者支持。十二祖巫及妖族高层以修为受损的代价获取了部分天机，得到了部分联盟修士的行踪。
经过严密的布置后，巫族十二祖巫及妖族天帝皆亲自出动围困众神，经过数十万年的围困，巫妖分别降服了五位准圣及大量的大罗金仙高手，其他的准圣高手一看不对劲，皆撤离中央大陆远循海外各自逃命。
亚圣面对面可杀死准圣，但是准圣一心要逃的话，亚圣也不一定追得上。五十位准圣只有不到十位最差的准圣被巫妖两族困住，其他的皆逃往海外隐藏起来。而准圣以下的其他联盟高手皆被巫妖两族捉住、降服。
洪荒大清理的行动，虽然使得巫妖两族领地的普通修士，因准圣报复而死伤惨重，但巫妖两族的高端战力却因此强大了不少，并且借口清理了大部分的洪荒势力，即便巫妖之争最后两败具伤，洪荒中所余的势力也不会对巫妖两族有大的冲击。至于三清圣人门下势力，数个量劫以来都没有加入洪荒争斗，自然不会对巫妖双方进行打击。
洪荒势力大清洗后，巫妖双方都开始大量筹备兵员，亿亿吨的先天后天材料被制造成兵器或大型战斗舰艇，为了进行大兵团的运输及战斗，巫妖双方都对战舰进行了无数年的研究，新一代的战舰可载员上十万，每时辰可飞行百万亿公里之远，在十万修士同时输入能量的情况下，战舰的每一击可毁灭一颗星辰。
一量劫来，巫妖双方都大量制造这些战舰，无数的能量结晶及矿材被开采用于战舰的制造及供给能量，而争夺洪荒资源也是巫妖双方无数次战斗的根源之一。