蒙受了20年的欺骗，生母也在明道元年不明不白地死去，当仁宗知道自己的身世后，其震惊无异于天崩地陷。他抑制不住内心的悲伤，一面亲自乘坐牛车赶赴安放李妃灵柩的洪福院，一面派兵包围了刘后的住宅，以便查清事实真相后作出处理。此时的仁宗不仅得知了自己的身世，而且听说自己的亲生母亲竟死于非命，他一定要打开棺木查验真相。当棺木打开，只见以水银浸泡、尸身不坏的李妃安详地躺在棺木中，容貌如生，服饰华丽，仁宗这才叹道：“人言岂能信”随即下令遣散了包围刘宅的兵士，并在刘太后遗像前焚香，道：“自今大娘娘平生分明矣。”言外之意就是刘太后是清白无辜的，她并没有谋害自己的母亲。
李氏是在临死时才被封为宸妃的，刘太后在李妃死后，最初是想秘而不宣，准备以一般宫人礼仪举办丧事。但宰相吕夷简力劝大权在握的刘太后，要想保全刘氏一门，就必须厚葬李妃，刘后这才意识到问题的严重性，决定以高规格为李宸妃发丧。生母虽然厚葬，但却未能冲淡仁宗对李氏的无限愧疚，他一定要让自己的母亲享受到生前未曾得到的名分。经过朝廷上下一番激烈争论，最终，将真宗的第一位皇后郭氏列于太庙之中，而另建一座奉慈庙分别供奉刘氏、李氏的牌位。刘氏被追谥为庄献明肃皇太后，李氏被追谥为庄懿皇太后。
心里变态的萧耨斤最终不顾亲生儿子的劝阻，私自下令把萧菩萨哥迁到上京囚禁，最后甚至派出了刺客去刺杀萧菩萨哥。
萧菩萨哥看到刺客以后，并没有太过惊讶，她早就知道萧耨斤不会那么轻易放过自己，所以早就做好了随时赴死的准备。她看着刺客，平静地说：“我的清白，天下人都很清楚。所以，你稍等一会儿，让我沐浴更衣，死也死得清清白白。可以吗”
刺客听了萧菩萨哥的话，心生怜悯，于是暂时退了出去，等他再回来的时候，萧菩萨哥已经沐浴更衣自缢身亡了。萧耨斤觉得还不解气，又命人按照庶人的礼仪，把萧菩萨哥的尸体葬在荒山野岭里。
萧耨斤摄政以后，内心深处的黑暗因子完全被激发了出来，不但大肆扑杀朝廷大臣，疯狂提拔、重用亲信，连自己的亲生儿子耶律宗真也没放过。她不仅派人密切监视耶律宗真，而且一旦心血来潮，就肆无忌惮地打压耶律宗真。
萧孝穆是萧耨斤的哥哥，耶律宗真的亲舅舅，而且他的女儿萧挞里是耶律宗真的妃子，还生了皇子耶律洪基，也就是未来的道宗皇帝，可以说他是萧氏家族中与耶律宗真关系最密切的人。
最重要的是，他从开始做官，到后来加封东平王、赐佐国功臣、调任东京留守，能够一路平步青云，成为契丹重臣，靠的完完全全是自己的能力，所以十分看不惯萧耨斤的做法。萧耨斤摄政以后，多次赏赐财物给萧孝穆，想跟哥哥拉拉关系，萧孝穆也毫不领情，全部原封不动地退了回去。
耶律宗真知道，对于这样一个人品端正、办事公道、懂事理、识大体、顾全局的人来说，唯一能够打动他的就是政治上的利益。所以，耶律宗真效仿爷爷耶律贤，跟萧孝穆做了一笔“政治交易”：萧孝穆支持耶律宗真夺回皇权，耶律宗真改立萧孝穆的女儿萧挞里为皇后，并提拔萧孝穆为北院枢密使。
萧孝穆一开始支持妹妹萧耨斤摄政，完全是为了打击齐天皇后萧菩萨哥家族的人，同时为了从国舅大翁帐手中夺回皇后宝座，所以他觉得既然女儿能够被封为皇后，目的也就达到了，萧耨斤就没必要继续摄政了。于是，他爽快地答应了耶律宗真，开始全心全意支持耶律宗真夺回皇权。
萧朴是萧耨斤的族中兄弟，但跟萧孝穆一样，并不十分赞同萧耨斤的做法。当初萧耨斤加害萧菩萨哥，萧朴就表示过强烈的不满，甚至干脆站出来劝说萧耨斤得饶人处且饶人。后来萧菩萨哥被逼自尽，萧朴又多次为她伸冤，希望能够给她一个公正的评价。这样一来二去就惹怒了萧耨斤，最后萧耨斤终于忍无可忍，一怒之下把他打发去了东京。对于这些，耶律宗真当然心知肚明，于是动之以情、晓之以理，很快就把萧朴拉到了自己一边。拉拢了萧氏兄弟以后，耶律宗真并没有就此罢休。为了增加更多胜利的筹码，他又把目光放在了亲妈身边的耶律喜孙和赵安仁等人身上。