1542年，神圣罗马帝国皇帝查理五世派遣天主教教士进入波希米亚（捷克），意图在波希米亚复兴天主教，并任命哈布斯堡皇室的斐迪南大公为波希米亚国王。斐迪南是一名狂热的天主教徒，他对波希米亚的新教徒进行大规模的迫害，并禁止新教徒的宗教活动，拆毁他们的教堂。
神圣罗马皇帝查理五世（卡洛斯一世）和他的弟弟奥地利大公斐迪南一世的领导下，哈布斯堡王朝夺取了波西米亚布达和匈牙利。
1542年5月23日上午8点半，波希米亚议政大厅，神圣罗马帝国皇帝查理五世的四位使臣亚罗斯拉夫·波西塔·冯·马丁内斯、克鲁姆、斯滕堡和罗科维茨穿着正装早早到达与会目的地。
他们此行的目的是与新教代表索恩伯爵就皇帝下令拆除新建的新教教堂一事进行谈判，并宣读皇帝对新教徒的敕令。另一方，索恩伯爵是个典型的不安分的新教徒贵族，不久之前被波西米亚国王斐迪南大公下令革除在卡尔施塔特的封地，这块封地被转封给马丁内斯。醉翁之意不在酒，新教徒其实对谈判本身并不关心，他们打算在此次会晤过程中寻找借口，并盘查他们是否曾在皇帝面前劝国王采取反新教政策。
会议开始没多久，新教徒人群当中的极端分子便开始发难攻讦皇帝使臣是罪魁祸首，要求当众处死他们，场面开始陷入混乱，狂热的情绪开始在新教徒中间迅速扩散。皇帝的使臣们发现情况不妙，当即表示下周五将会收到皇帝对他们诉求的回复，狂热的新教徒们并没有平息下来，谈判会议旋即演变成了审判大会。
由于斯滕堡和罗科维茨是温和派，而且他们在新教徒领地拥有地产，因而被新教徒认为无罪，因此被架出大厅当即释放。而马丁内斯和克鲁姆以坚定的天主教徒闻名，面对狂热的新教徒，他们并不打算在他们面前屈服。
在索恩伯爵的煽动之下，狂热的新教徒逼向马丁内斯、克鲁姆和书记官菲利普·法布雷加斯，将三人从10多米高的三楼窗户上推了下去。他们设法用指尖勾住窗户边缘，但在重击下，被迫松手，他们惨叫着掉了下去。所幸的是，楼下有厚厚的干草和粪便堆积的草堆，因此三人奇迹般地幸存下来。
他们大难不死的事迹被天主教阵营宣传是虔诚者受到圣母玛利亚庇佑显灵的结果，是圣母派遣天使在空中托住了他们。坠楼三人随后向国王汇报了波希米亚新教徒已经揭竿而起的消息，波西米亚国王斐迪南大公在大为震怒之余不忘嘉奖三人，并为法布雷加斯加封爵位，封号为BaronvonHohenfall，意为高空坠落男爵。
这件事导致了欧洲战争爆发，战火蔓延整个欧洲，真是史无前例，与之相近的大概只有后来的拿破仑战争或者是两次世界大战。掷出窗外事件成为了压死骆驼的最后一根稻草，这个小火星将神圣罗马帝国的内战推向不可挽回的境地。全面欧洲战争一触即发，双方都开始厉兵秣马，积极备战。
波希米亚新教贵族随后宣布，不会再承认斐迪南一世为他们的国王。这意味着波希米亚人不再承认哈布斯堡家族的统治，企图在波希米亚改朝换代，这就令怒火中烧的斐迪南对波希米亚新教徒更加痛恨不已，他决心以武力血腥镇压。
1542年7月26日，波希米亚首都布拉格的新教徒发动起义，冲进王宫，将神圣罗马帝国皇帝的三名钦差从窗口扔了出去，是为扔出窗外为二次抛出窗外事件，并成立临时政府，由三十位成员组成，宣布波希米亚独立。
神圣罗马帝国在公元1526年吞并了捷克。当时的大帝国已是名存实亡。奥地利成为诸侯中最有势力的国中国。奥地利的皇帝来自哈布斯堡家族，所以，捷克并入德意志的版图，实际上成了奥地利哈布斯堡家族的领地。
1542年，哈布斯堡家族的斐迪南一世受神圣罗马帝国皇帝之封为捷克和奥地利国王。捷克在归入哈布斯堡家族领地之时，奥地利皇帝曾有过承诺：不论是哈布斯堡家族的哪一个成员作国王，都必须承认并遵守捷克王国的法律，保留原有的议会、宗教以及政治上的自主权等等。
然而，自从斐迪南一世，这个捷克人眼里的魔王一上台，一切都变了，他根本不承认哈布斯堡家族曾经有过的承诺，完全把捷克当作奥地利的附庸国。什么捷克的法律，什么自己的议会，什么自主权通通被取消了，从城市到乡村凡是能插手的地方，他都派了自己的官员捷克人彻底沦为奴隶。捷克人的心中蕴蓄着怒火。这时另一件事的发生，对于捷克人来说，无异于火上浇油。
1543年的一天，愤怒的捷克人民终于开始了自己的反抗行动。
那一天是5月23日，一群武装群众和新教徒手拿铁棒长矛冲进了王宫，国王吓得仓惶逃窜，愤怒的群众在搜寻中逮住了两个斐迪南国王最忠实的走狗。两条平日里耀武扬威的走狗，已没有了昔时作威作福的神气。只有瑟瑟发抖，摇尾乞怜的份了。看见两条走狗的“熊”样，人们更加愤恨，突然不知是谁喊了一句：“把他们仍到窗外去！”.
“对，扔出去摔死他！”立时有无数愤怒的声音在响应。在一阵怒吼声中，两条走狗被人们按照捷克人的方式，从20多米高的窗台狠狠摔了下去。两条走狗活该命大，竟没有摔死，只是昏晕了而已。
“掷出窗外事件”使得欧洲统治者们大为震惊。斐迪南决定说服哈布斯堡家族发动一场战争。一举扫平捷克，让捷克人老老实实地听从自己的摆布。怒火尚未平息的捷克人更加愤恨，他们纷纷组织起来，武装自己。高喊着：
打到奥地利去！
彻底推翻哈布斯堡家族
让斐迪南滚蛋！
这些捷克人组成了自己的临时政府，选出了30名保护人（其中大部分是新教贵族）领导起义。群众占领了政府各部门，废除了一切法规，取消了一切赋税，把天主教会分子，打得屁滚尿流，夹着尾巴逃掉了。
起义军开始时所向披靡，杀进了奥地利境内，直逼维也纳，奥地利的新教徒们一向也不满皇帝的一些政策，借此机会纷纷响应。此时奥地利的老皇帝已经死掉了，正巧是捷克人眼里的那个“混蛋”皇帝斐迪南接任皇位。听到捷克义军已兵临维也纳城下，斐迪南吓得面无人色，那些王公大臣们也是缩成一团，瑟瑟发抖。
没有人知道除了发抖外还应该做些什么，一个年长的老贵族吓得一边抽着流出来的鼻涕，一边含混不清结结巴巴地说：“陛……陛……陛下，你……你快派人去……去谈判呀……”正在这时，有人报告说起义军派代表来谈判了。
斐迪南一世擦了擦额头的冷汗，把十个手指绞在一起，一双鼠眼转了几转，计上心来，“对，就这样干！这帮刁民，等着瞧吧！”斐迪南一世派出他的一个亲信作为全权代表去同起义军领袖谈判，其实这只是他玩的缓兵之计，暗地里他早派人去西班牙国王卡洛斯一世那搬讨救兵了。
这时的起义军如果能一鼓作气攻进王宫，胜利唾手可得。然而起义军的领导权全部掌握在捷克贵族手里，这些贵族们在紧要关头又暴露出自私狭隘动摇不定的弱点来。一方面他们要迫使国王让步，从中得到实惠，一方面又害怕如果起义真的胜利了，群众的声势大起来会损害自身的利益，所以这些新教贵族们一再主张谈判，斐迪南的奸计就这样得逞了。
一天深夜，当起义军的战士正在沉睡的时候，西班牙军队从背后偷袭了，斐迪南的军队也从正面发动了进攻，起义军腹背受敌，伤亡惨重，一退再退，退回到了捷克。那些捷克的贫苦百姓们斗志不减，表示只要有一息尚存，决不屈服强权。可恨那些领导者们开始动摇、叛逃，严重削弱了起义军的力量。
1543年11月初，两军在捷克首府布达佩斯附近决战，由于叛逃者出卖了起义军，加上敌我力量悬殊，起义战士纷纷倒在了自己的土地上，为了保卫自己的土地流尽了最后一滴鲜血。起义被残酷地镇压下去了，斐迪南又神气活现地坐上了他的宝座，捷克人民再次陷入奥地利的残酷统治之下。
神圣罗马帝国内战给了协约国一个武装干涉的机会，是由神圣罗马帝国的内战演变而成的一次大规模的欧洲国家混战，也是历史上第一次全欧洲大战。
这场战争是欧洲各国争夺利益、树立霸权的矛盾以及宗教纠纷激化的产物。
推动了欧洲近代民族国家的形成，是欧洲近代史的开始。