那一夜，是九黎部族彻底黑化的一夜，他们遭到黄帝的背叛被赶出了逐鹿之野，死伤无数！蚩尤至此立下毒誓，有生之年一定要将逐鹿之野夺回来，要把轩辕黄帝的狗头挂在逐鹿之野的城墙上，要和炎黄部族不死不休。
往后的故事就像历史正文中记载的那样，残酷的神魔之战爆发，轩辕黄帝率领的炎黄部族与蚩尤魔帝率领的九黎部族展开无休止的征乱，最后决战于逐鹿之野。
到逐鹿之野决战之时，炎黄部族已现颓势，这是因为炎黄部族很多高等级神被杀死后不愿意就此泯灭而去，选择将强大的神魂附着在精心铸造的器物上，再由弱小的人类使用器物，他们反噬人类达到残存于世的目的。
可是失去了肉体的他们实力远远低于拥有肉体的时候，并且由于他们不愿意死去，导致新生神无法诞生，导致炎黄部族战斗力持续下降；反观九黎部族，它们就很少出现这样的情况，神明死亡之后多会选择就此死去，让可能更加强大的新神诞生，以填补自己的位置，表现得大度而无私。
此消彼长，炎黄部族战斗力越来越差，眼看又要守不住逐鹿之野了。就在此时，轩辕黄帝提出与蚩尤魔君单挑，理由是这样可以减少本族成员的死伤。
他心里打的什么鬼主意谁都清楚，可是蚩尤魔君一来确实不愿意伤亡继续扩大，二来自信心过头，张狂自大，认为轩辕黄帝不是他的对手，便不顾众神的反对从容接受挑战。
两大顶级之神决战于逐鹿之野城外的战场上，结果是，轩辕黄帝用计诈败，引诱蚩尤来到逐鹿城下，再枉顾之前达成的协议与早就埋伏在那里的旱魃九龙以及应龙神君三神联手砍下了蚩尤的头。
蚩尤被伏，坐下第一大将夸父怒气井喷，直接冲了过去，结果也被杀死。
两大顶级战力相继死去，局势向着炎黄部落无限倾斜，九黎积攒了数十年的优势顷刻之间土崩瓦解。
至此炎黄与蚩尤的争斗局势已然明朗，蚩尤战死，高等神占据绝对优势，故事本该就此结束。然而事实并非如此，后面的事情则更加离奇恐怖，甚至匪夷所思！
原来，当时黄帝手下养着一群宠物，那些宠物平日里看起来人畜无害的，每天要吃掉的东西却很多，需要不断提供活着的人畜或者古神的尸体去喂食。宠物们被轩辕黄帝半公开的饲养着，不断打扫战场上的尸体，由于战争的激烈没有神注意到它们的异常。
然而，就在蚩尤、夸父惨死，炎黄部族杀出逐鹿之野要对九黎部族进行灭绝性屠杀的时候，轩辕黄帝圈养的宠物们忽然破笼而出了，露出狰狞的样子向着毫无准备的高等神张开血盆巨口。
一开始高等神以为是宠物们闻了血腥味道忽然发狂不受控制了，看着轩辕黄帝的面子放弃了大动干戈；后来看到它们吃了神之后变得越来越强大，并且轩辕黄帝也一点没有要阻止的意思。高等神终于醒悟过来，原来本族的最高存在已然背叛了他们，就如同背叛挚友蚩尤那样轻松随意。
钧天剑指向了曾经的同族，嗜血的宠物铺天盖地的袭来宛若梦魇，强大的古神们与它们进行了艰苦卓绝的战斗，最后以战败告终。
在临别时刻，轩辕黄帝给了所有神一个重新来过机会，他将死掉的神魂一一封印在早就准备好的坚固器物中，将逐鹿之野沉入地底，将一切封印起来。临别之时，轩辕黄帝告诉所有被封印的神明，万年之后你们将会获得一个重见天日的机会，你们将走向通往又一次大决战的道路，并在大决战之前重获肉身，在此之前任何神不得将今日的事情吐露出去，否则那个重见天日的机会将会消失。
由此，众神强盛的时代远去，九龙、玄女等等强者只能依附于剑上沉眠，在沉睡中等待不知何时才会出现的解救者，逐鹿之野沉入地底遭到封禁。
于逐鹿之野大决战中残存下来的古神们，包括了胆子很小不愿意上战场的的高等神，以及战败后躲起来的九黎神，他们同时选择遗忘过去的荣耀，遗忘痛苦的历史，以低调的姿态苟活。由于实在太孤独太无聊了，它们无尽寿命的大多数时间都在沉睡。
轩辕黄帝就此消失，消失之前带走了曾经挚友蚩尤的头和武器，将蚩尤的头扔入大海，将蚩尤的武器霸王旗旗帜撕碎，旗杆丢入昆仑山脉，形成今日的金戈峰。
蚩尤魔帝圈养的人类奴隶，其中一少部分在九黎部族兵败撤退的时候侥幸逃离了逐鹿之野，对于九黎神的颓废与自暴自弃无力阻止，对于蚩尤魔君的恩义始终铭记于心，历尽千辛万苦来到金戈峰建立了新的部族，艰难求生等待主人重新降临，经年累月逐渐演化形成今日的蚩尤堂，历代圣教教主在此出现。蚩尤堂的名字代表了山人对主人的思念，代表了等待主人归来的决心。
以上，就是万年前神魔大战的全部真相，其中的诡诈反转令人震惊。原来导致古神衰落的原因，是它们中间出现了叛徒，而那个背叛者则是带领高等神打败了九黎部族的轩辕黄帝。
战胜蚩尤之后，轩辕黄帝立刻向昔日的同袍举起了屠刀，堪称无情无义的典型代表。
由于他的屠杀，绝大多数的九黎神和炎黄神都死在了逐鹿之野，逃出去的只是很小的一部分，这些神即便逃了出去，也永远活在那一天的阴影之中再也不愿意相信任何神。
到千年前，青山道祖为了圣教和蜀山的平衡来到金戈峰，找到当时的蚩尤堂堂主将一把威力无比的神剑交给了他。这把神剑的名字叫做九龙，是青山道祖从逐鹿之野带回来的，青山道祖告诉蚩尤堂堂主，终有一天，魔王会持着九龙回归大地，众神将因为魔王的回归而重见天日。
往后的日子里，历代圣教教主都从蚩尤堂诞生，其中没有一人担得起魔王蚩尤的神魂。直到水君月带着九龙一起消失，拥有蚩尤神魂的叶飞被九龙指引回到金戈峰，因果轮回才终于走完。
了解了这段历史真相之后，叶飞心中产生几个疑问：第一，轩辕黄帝一定是天道派来九州的内奸了，他带着天道的任务而来，为了完成任务而蓄养天道的打手饕餮，利用战争让饕餮越来越强大，最后在炎黄部族与蚩尤部族两败俱伤的时候，放出饕餮全灭了所有神族的精锐。那么问题来了，吃掉了无数神族的饕餮去了哪里呢，轩辕黄帝又去了哪里呢，它们都拥有着无尽的寿命不可能平白无故的消失啊。第二，天道到底为什么要做下这个局呢，难道真的在万年之前就预见到了人族的兴盛，又预见到人族最兴盛的时候众神将会回归？未免太离奇了吧！如果真的要颠覆神族，为什么不趁此机会将残存的众神彻底灭掉呢；第三，青山道祖是怎么回事？为什么他也准确的给出了预言，预言到蚩尤会回归，甚至从未可知之地带来了三把神剑。在青山道祖之前九州大地上是没有仙剑出现的，在青山道祖之后仙剑如雨后春笋一样破土而出，他究竟怎么做到的？难道他也是天道的使者吗？第四，无涯道祖是不是被青山道祖害死的，如果青山道祖是天道的使者则很有可能，毕竟无涯道祖领悟了逆转乾坤之道术。可问题是，无涯道祖的出现似乎对于历史也有推动作用，没有他就不会出现九州现在的格局，就不会有蚩尤堂，不会有人神之战，更不会有蜀山和青山道祖，无涯道祖的真实身份是什么？