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接下来几天，皇甫嵩、朱俊遣派出去的各路人马络绎归来。六天后，孙坚率部到。
孙坚追彭脱至思善，咬上了彭脱的尾巴，一曰两战，两次大败彭脱，彭脱所带之数千人马星散溃逃，最后只剩下了百十骑护着他仓皇逃走。
孙坚轻骑急击，率祖茂、韩当等十骑夜追二十里，在涡水南岸的楚灵王遗迹章华台附近追上了他，趁其欲渡河而不能，击之，以十敌百，浴血战，呼喝不绝，尽杀其从骑。彭脱走投无路，策马下河，试图强渡，韩当於岸上挽弓把他的坐骑射伤，他栽倒水中，孙坚脱甲弃马，只穿单衣，挟刀下水，在河中把他抓住，将之杀死，血染衣臂，提其首级而还。
从章华台渡过涡水，再向东北前行不多远就是沛国，总算在彭脱逃出汝南之前把他斩杀了。
荀贞出县相迎，笑对他道：“章华台旧地是郑庄公演武厅之所在，郑庄公勇敢多智，冠绝诸侯，春秋小霸，今文台兄夜战水斗，斩杀彭脱，使汝南全郡平，功绩不让先人。”
孙坚自得大笑。
孙坚部是最后归来的一支汉军。历经月余的鏖战，十余万汝南黄巾或战死、或被俘、或星散，诸多渠帅要么被斩杀，要么已投降，至此，汝南全郡光复，郡中再无一支成建制的黄巾军。
就算成果，斩首数万，俘虏数万，缴获的各种物资如山堆积。
皇甫嵩、朱俊一边写捷报送去朝中，等候朝中旨意，一边着手处置俘虏。经过颍川、汝南两战，汉兵损失不小，皇甫嵩、朱俊经过商量，决定不再坑杀俘虏，而是从中选精壮可用者八千余人，充入军中，余下的悉数转给赵谦，由他发落安排。
汝南黄巾对汝南造成的损害远比颍川黄巾对颍川造成的损害大，颍川黄巾因为没有打下阳翟，受到荀贞的抗击，所以只是对颍川郡南的几个县造成了比较大的危害，而汝南黄巾却几乎把汝南全郡都打下来了，打下来后烧杀抢掠，接着汉兵入境，又激战不断，使得大量的人口或死在乱中，或逃亡它地，连郡治平舆如今都是十室六空，其它的县可想而知。战乱耽误了春种春耕，虽然现已是四月，补种粮食是来不及了，可在其它地方，比如修缮城墙、修治县寺等等方面却也是需要大量人手的，有了这批俘虏，减轻了赵谦不小的压力，他欣然接受。
荀贞部本有千二百人，伤亡三百余，尚存九百人，在受降了何仪后，他从黄巾军的俘虏中选出了二百人，给何仪带领，但这区区两百人不够补充他的损失，为了接下来的战事，皇甫嵩拨给了两千俘虏，由他自行编制。他本部只有九百人，俘虏两千人，远多於他的本部，为了编制这两千人，他绞尽脑汁，最终采纳了荀攸的意见，从其中选出三百，打乱编入本部，将剩余的一千七百人并与何仪所部之两百人，共计一千九百人编为两部，一部九百人，由何仪统带，另一部千人，由许仲、刘邓统带，从本部中选了一些武勇的亲信充任中低层的军官，其中包括原盼等这些投奔他的繁阳亭太平道信徒。至於许仲、刘邓原本统带的蹶张士、陷阵士，改由陈到、典韦统带。在汝南的这几场仗，典韦、陈到立下了很大的功劳，可以任用了。
经过整编，荀贞部从早先的一千二百人扩充到了三千一百余人。傅燮、孙坚等部也各有扩充，孙坚部早先也是千余人，如今亦扩充至了三千余人。当然，不是所有的汉军部曲都得到了扩充，皇甫嵩是按照战功拨给他们俘虏的，战功小的扩充的就少，没战功的就得不到扩充。
四月中旬，全军整编完成，入颍川前汉军四万余人，现有近五万人，从整体上来说，规模并没有得到扩大，仍与原本的兵额相仿。——这却也是皇甫嵩的谨慎之处。历经大战，汉兵总计伤亡六千余，战力受损，不补充不行，可也不能补充太多，补充太多说不定就会引起朝中的猜忌。自古以来，领兵出战固是一个获取功名利禄的捷径，可却也不乏因战功太大而反而获罪的。皇甫嵩、朱俊又算是党人清流一派，更得时刻防止宦官们的暗算，万不能倒持太阿，授人以柄。
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这天，圣旨下来，同时来的还有一个令人震惊的消息。