在神和镇的华丽大赛结束后第二天早上，小智几人正准备离开了，但是走到宝可梦中心的大厅时，电视里传来了他们有些在意的新闻，于是停顿下来
‘现在是关于今早发生的金刚宝珠被抢夺时间的特殊报道，不幸中的万幸，运送金刚宝珠的飞机安全着陆了，没有造成人员伤亡，根据搭乘飞机的君莎警官所说，此次行动的作案团伙是自称银河队的秘密组织’
“是银河队”，小刚听到后立刻反应过来，他们之前在帷幕市有见过，当时他们也是不怀好意
‘早有传言，银河队一直在神奥地区各地进行秘密活动，前不久发生在帷幕市的陨石袭击事件，与他们有关。但是，他们的目的尚未查明。本次被偷的传说中的金刚宝珠，是正打算从百代市的历史博物馆搬运到神和镇的历史研究所。历史研究所里保管有与金刚宝珠相对应的白玉宝珠，因为此次事件，已经加强了警戒。这次金刚宝珠的转移是为了研究两个宝珠会不会有什么联系，由于金刚宝珠被夺，预计会给神奥的历史研究带来很大的障碍’，电视里继续报导
“事情变得糟糕起来了，冠军都回来了”，一旁的乔伊小姐忧心忡忡
“是竹兰小姐吗？”，小光听后问
“是的，她到历史研究所了，神和镇是竹兰小姐的家乡，她奶奶是研究所的所长哦”
“我们去看看吧”，小智之前在帷幕市见识过银河队的作风，因此决定想去看看，如果他们还是不死心的作恶的，自己会继续阻止他们的
随后众人感到历史研究所，刚一到达，小光就被研究所的规模给镇住了，而且周围还有一些警车，而小刚那边第一时间就发现了神奥的冠军竹兰小姐
“啊，华丽的冠军。”小刚看到美丽的大姐姐旧病复发，不过突然他自己又愣了一会
“诶？没来”，就在小刚以为自己又会被不良蛙毒击的时候，往常的感觉居然一直没来，小刚从花痴中恢复过来，回过头就看到不知何时出来的不良蛙正一动不动的眺望着远方的大楼
“竹兰小姐”，‘皮卡丘~’，‘波加’，智光两人也走上前打招呼
“是你们啊，好久不见了”，竹兰看见来人也露出笑脸
“这些孩子是？”，老奶奶问道
“我之前跟你说过的，我遇到了两个处事态度完全相反的孩子”，竹兰小姐和老奶奶说
“哦，这就是那个小孩的反面咯”
“小智，这是我奶奶，这座研究所的所长”
“奶奶你好，初次见面，我是小智，这是我的搭档皮卡丘”，‘皮卡~’
刚光两人紧随其后分别做了自我介绍
“我是芥子兰，请多关照，孩子们”
“不良蛙，怎么了吗？”，小刚看着仍旧在那里一动不动的不良蛙有点担心
“也许该是感知到那座大楼顶部有什么东西在，君莎小姐能不能麻烦你派人去查看一下，也许有银河队的人，他们可能正在打算抢夺白玉宝珠”，竹兰推测到，对身边的君沙小姐说
“好，我知道了”，君莎小姐看到相信冠军竹兰的判断立马就去安排手下做事去了
“你后来和真司怎么样了？”，竹兰小姐似乎对于小智和真司的后续还是很关注的
“有遇到过，其他方面还好，但是在小火焰猴，不…现在是猛火猴了，我们两个的意见始终不同”，小智想起真司，直接说出了两人不同的方向
“噢哈哈哈”，此时突然，远处传来莫名的笑声，吸引了大家的注意
大家看过去，发现是一个身穿灰黑色西装的男士，大概接近30岁的样子，一头蓝色刺猬头，笑哈哈的走了过来
“啊呀，今天的客人真多啊，又来了一个不成气候的人”，老奶奶面对普通客人还是挺有善意的
“你应该是赤日先生吧，支撑神奥经济的著名企业家”，竹兰小姐认出了来人
“被冠军这么说实在是我的荣幸”
“神奥有很多大楼和图书馆都是这位赤日先生建造的”，竹兰向小智他们解释
“虽然长得不怎么样，但确实是神奥经济圈的名人哦”，芥子兰奶奶走到赤日身边打趣道
“说我是名人，真是不好意思啊”，赤日不好意思的挠着后脑勺，明明被这么说了，却还是没有什么明显的反感情绪，依然表现的平易近人
“我现在不过是一个在研究神奥历史的新手”
“大概是担心白玉宝珠才来的吧”
“是的，我看到金刚宝珠的新闻就坐不住了”
‘皮卡丘…’，“皮卡丘，你也觉得很奇怪吗？”，皮卡丘和小智似乎都感觉到了赤日的不对劲之处，但是看竹兰和老奶奶都很友善的样子，小智和皮卡丘也觉得现在不方便打扰他们之间的交流
随后大家在芥子兰博士和竹兰小姐的带领下走进了研究所，芥子兰博士开始向大家述说着自己的见解，研究所的墙上还有雕着帝牙卢卡和帕路奇亚的画像
“这座小镇从很久以前就跟帝牙卢卡、帕路奇亚有很深的渊源，随着我开始调查镇子的起源，资料就像山一样，越堆越多，最后就我的研究所成这个样子了”，走进研究所的书架处后，便看见上面满满当当的都是资料，堆积成山
继续向内部走去，打开一扇门后，映入眼帘的是一幅壁画，是一个蚀刻浮雕，下方还摆着有文字的石板
浮雕是一个正三角形，中央一个如同太阳的金色标记，向三个角落辐射，三个角上各印有一只小型宝可梦的模样，分别呈现粉蓝黄三色
“哇，好厉害的壁画”，小光率先一步走了过去，不过看到三角的一只宝可梦图案便停了下来
“诶？这个是我们见过的艾姆利多吗？”，小光看着左下角的宝可梦标记说道
“说起来我之前也见过这里只蓝色的宝可梦”，小智和皮卡丘也发现了上面还印有一只自己也见过的宝可梦
“这太惊人了”，芥子兰奶奶听后惊呼，一旁的竹兰和赤日也一脸惊讶
“是在哪里？”，竹兰小姐急切的问
“是在心齐湖”，‘波加’
“我是在立志湖看到的”，‘皮卡’
“太不可思议了，竟然有人看到过被称为湖之众神的宝可梦，上面那只是智慧之神由克希，被认为是生活在切锋市旁的睿智湖。这三只据说各自隐匿在神奥的三湖中，但它们的存在仅仅是传说罢了”，竹兰小姐说道
“有种说法是，它们只有灵魂从湖里出来，守护着人们的生活，你们看到的说不定是它们的灵魂”，芥子兰奶奶补充着三圣菇流传下来的信息